歷經二次仲裁、耗時10年的臺東焚化廠爭議案，今天(28日)在環保署第一筆2.6億補助款確定入帳後，終於圓滿落幕。在第一次仲裁中，廠商原本要求縣政府必須給付近30億元賠償金及仲裁費用，黃縣長在上任後，為求將財政負擔降到最低，立即督促組成專案小組，全力面對仲裁，捍衛縣府與縣民的權益。
在100年3月31日關鍵的第二次仲裁中，仲裁協會最終以垃圾減量為由終止合約，並判定縣府給付19.6億，補償廠商的焚化廠興建等費用，此結果比當初廠商所要求的賠償費用減少近10億元，此外，焚化廠的產權也完全移轉給縣政府。
黃縣長指出，縣府若不依仲裁結果付款，將馬上面臨縣庫被查封、縣產被拍賣的命運，同時，債務也將以1億的龐大年息不斷累積。然而地方多數民意並不贊成營運，在「絕不債留子孫」的前提下，黃縣長與縣府團隊提出「功能正常備用廠」的概念，既能達成仲裁要求取得產權，同時也能「備而不用」，符合垃圾減量的精神。經過多次北上向中央爭取協助，終於獲得行政院與環保署的支持，臺東焚化廠轉移後至民國116年，將維持備用的狀態，並由中央逐年補助共約21億元。
此外，由於焚化廠補助期程長達16年，環保署為保證往後每年度有穩定的補助款預算，故修訂「鼓勵公民營機構興建營運垃圾焚化廠推動方案」(修正草案)，並於100年12月30日提送行政院後轉經建會審查。101年度經縣政府及環保署努力修訂及多次行政院跨部會研商會議後，行政院於101年11月23日同意環保署提出之的方案，並於隨後與縣政府簽訂「臺東縣垃圾焚化廠建設經費補助協議書」。
這個月14日環保署至焚化廠進行現勘查核工作後，即認定縣政府辦理的焚化廠備用工作符合補助標準，並於今日撥付101年度補助款2.6億餘元至「臺東縣一般廢棄物清除處理基金」中，讓拖宕10年的焚化廠一案圓滿落幕。